Op basis van de stimulus kan men inzoomen op een centrale vraag die toelaat een aspect van wetenschap te verkennen. We spreken van de NoS-vragen. Deze hoofdvraag kan zelf worden geformuleerd door de leerlingen of het kan ook één van de hier aangeboden vragen zijn.
Een hoofdvraag gaat gepaard met bijvragen die toelaten het thema verder uit te spitten en verwante onderwerpen aan te snijden.